1.国家自然科学基金面上项目：半夏泻心汤通过LncRNANEAT1/miR-186-5p/PTEN、STAT3信号轴调控胃癌前病变细胞自噬的机制研究（82274442），2023.01-2026.12，52万元，李慧臻主持，在研。

　　2.国家自然科学基金面上项目：半夏泻心汤调节胃癌前病变“菌-炎-癌”致病途径的Treg/Th17免疫失衡的分子机制（81573889），2016.01-2019.12，57万元，李慧臻主持，结题。

　　3.国家自然科学基金面上项目：基于NF-κB/STAT3信号通路研究半夏泻心汤对胃癌前病变“微环境调和”的作用机制（81273708），2013.01-2016.12，72万元，李慧臻主持，结题。

　　4.天津卫生健康委员会中医药重点领域科研项目，基于“治未病”理论探讨半夏泻心汤在胃癌发生、发展过程中对Notch信号通路的影响及作用机制（2020007），2020.1~2022.12，结题，主持。

　　5.天津卫生健康委员会中医药重点领域科研项目：柴胡疏肝散调控Sonic Hedgehog信号通路改善非酒精性脂肪肝性肝炎的机制研究（2023012），10万元，2023.1-2025.12，李慧臻主持，在研。

　　6.国家重点研发计划，健脾活血方治疗胃癌前病变临床循证评价及其疗效机制(2017YFC1700601)，2018.1~2021.12，结题，分中心负责人。

　　7.天津市卫生局科研项目，粘膜微血管状态、VEGF与胃癌前病变程度相关性研究（2011KZ123），2011.06~2013.05，结题，主持。

　　8.天津市教委科研基金项目，健脾活血法对胃癌前病变P16基因甲基化的影响（20080262），2008.12~2011.12，结题，主持。

　　9.天津市卫生局中医中西医结合基金项目，胃安散促进胃癌前病变胃黏膜免疫有效抗原成分的多源性作用（2005013），2005.10~2012.01，结题，主持。

　　10.天津市教育委员会高等学校科技发展基金项目，胃安散对胃癌前病变HP及调控基因P53的影响，2003.01-2004.12，结题，主持。

　　11.天津科委重大课题：早起胃癌和胃癌前病变筛查及胃癌前病变的中医药干预诊疗方案研究（16YFZCSY01070），2017.2-2019.4，分中心，李慧臻负责，结题。